La Chorrera surgió como distrito el 12 de septiembre de 1550.
Sobre la fundación de la Chorrera es poco lo que se conoce, pero al menos se tiene como referencia que fue fundada por el gobernador Sancho Clavijo el 12 de septiembre de 1550. Los primeros habitantes de la región fueron indios quienes habían llegado de Venezuela y Perú a las provincias de Istmo.
En la zona conocida actualmente como la Chorrera, existía una hacienda que era propiedad de la española, Juana María Bautista de la Coba, quien disponía de 4 hectáreas con título de propiedad expedido por la el Gobierno español. En la hacienda se trabajaba la agricultura y ganadería, por ello un gran número de personas construyeron viviendas en las hectáreas para vivir y al mismo tiempo aprovechar las tierras, esto con el permiso de su propietaria. Es así como nació el pueblo la Chorrera.
El origen del nombre de la Chorrea se presume que se originó porque en la zona se localizaban varios chorros.