El 12 de abril de 1557 se fundó la ciudad de Cuenca ubicada al noroeste de la llanura de Paucarbamba.
Don Gil Ramírez Dávalos quien había sido enviado por el Virrey del Perú, Don Andrés Hurtado de Mendoza, se encargó de fundar Cuenca el 12 de abril de 1557. Don Andrés confiaba en Dávalos, por ello decidió comandarle la misión de fundar la ciudad, el sitio escogido para llevar a cabo la fundación fue un amplio espacio que se encontraba rodeado por ríos.
Desde la época colonial ciudad resaltaba por su cultura. Sus habitantes realizaban admiradas obras de arte, como: pinturas, esculturas, tallados y artesanías.
La ciudad de Cuenca se independizó de España el 3 de noviembre de 1820, aunque se hizo efectiva luego de la Batalla de Pichincha, el 24 de mayo de 1822.
La Gran Colombia y el Ecuador, hicieron que Cuenca fuese asignada como la capital del Departamento del Sur, y posteriormente de la provincia del Azuay.